Protein–RNA interactions for Protein: P51168

SCNN1B, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1BP51168 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCNN1BP51168 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCNN1BP51168 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCNN1BP51168 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SCNN1BP51168 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCNN1BP51168 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCNN1BP51168 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCNN1BP51168 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCNN1BP51168 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCNN1BP51168 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCNN1BP51168 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCNN1BP51168 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SCNN1BP51168 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCNN1BP51168 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCNN1BP51168 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCNN1BP51168 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCNN1BP51168 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCNN1BP51168 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCNN1BP51168 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCNN1BP51168 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCNN1BP51168 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCNN1BP51168 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCNN1BP51168 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCNN1BP51168 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCNN1BP51168 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCNN1BP51168 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCNN1BP51168 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCNN1BP51168 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCNN1BP51168 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCNN1BP51168 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCNN1BP51168 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCNN1BP51168 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCNN1BP51168 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SCNN1BP51168 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCNN1BP51168 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCNN1BP51168 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCNN1BP51168 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCNN1BP51168 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCNN1BP51168 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCNN1BP51168 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCNN1BP51168 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCNN1BP51168 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCNN1BP51168 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCNN1BP51168 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCNN1BP51168 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCNN1BP51168 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCNN1BP51168 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCNN1BP51168 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SCNN1BP51168 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SCNN1BP51168 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCNN1BP51168 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SCNN1BP51168 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SCNN1BP51168 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCNN1BP51168 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCNN1BP51168 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCNN1BP51168 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCNN1BP51168 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCNN1BP51168 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCNN1BP51168 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCNN1BP51168 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCNN1BP51168 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCNN1BP51168 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCNN1BP51168 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCNN1BP51168 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SCNN1BP51168 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCNN1BP51168 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCNN1BP51168 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCNN1BP51168 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCNN1BP51168 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCNN1BP51168 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SCNN1BP51168 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCNN1BP51168 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCNN1BP51168 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCNN1BP51168 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCNN1BP51168 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCNN1BP51168 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCNN1BP51168 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCNN1BP51168 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SCNN1BP51168 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SCNN1BP51168 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SCNN1BP51168 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCNN1BP51168 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCNN1BP51168 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCNN1BP51168 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCNN1BP51168 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCNN1BP51168 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCNN1BP51168 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCNN1BP51168 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCNN1BP51168 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCNN1BP51168 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCNN1BP51168 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCNN1BP51168 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCNN1BP51168 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCNN1BP51168 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCNN1BP51168 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCNN1BP51168 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCNN1BP51168 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCNN1BP51168 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCNN1BP51168 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SCNN1BP51168 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms