Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB28P51157 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB28P51157 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB28P51157 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB28P51157 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB28P51157 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB28P51157 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB28P51157 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB28P51157 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB28P51157 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB28P51157 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB28P51157 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB28P51157 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB28P51157 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB28P51157 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB28P51157 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB28P51157 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB28P51157 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB28P51157 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB28P51157 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB28P51157 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB28P51157 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB28P51157 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB28P51157 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB28P51157 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB28P51157 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB28P51157 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB28P51157 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB28P51157 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB28P51157 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB28P51157 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB28P51157 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB28P51157 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB28P51157 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB28P51157 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB28P51157 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB28P51157 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB28P51157 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB28P51157 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB28P51157 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB28P51157 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB28P51157 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB28P51157 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB28P51157 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB28P51157 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB28P51157 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB28P51157 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB28P51157 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB28P51157 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB28P51157 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB28P51157 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB28P51157 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB28P51157 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB28P51157 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB28P51157 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB28P51157 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB28P51157 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB28P51157 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB28P51157 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB28P51157 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB28P51157 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB28P51157 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB28P51157 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB28P51157 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB28P51157 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB28P51157 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB28P51157 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB28P51157 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB28P51157 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB28P51157 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB28P51157 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB28P51157 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB28P51157 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB28P51157 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB28P51157 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB28P51157 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB28P51157 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB28P51157 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB28P51157 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB28P51157 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB28P51157 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB28P51157 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB28P51157 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB28P51157 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB28P51157 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB28P51157 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB28P51157 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB28P51157 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB28P51157 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB28P51157 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB28P51157 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB28P51157 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB28P51157 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB28P51157 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB28P51157 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB28P51157 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB28P51157 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB28P51157 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB28P51157 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB28P51157 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms