Protein–RNA interactions for Protein: P50993

ATP1A2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A2P50993 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP1A2P50993 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP1A2P50993 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP1A2P50993 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP1A2P50993 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP1A2P50993 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP1A2P50993 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP1A2P50993 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP1A2P50993 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP1A2P50993 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP1A2P50993 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP1A2P50993 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP1A2P50993 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP1A2P50993 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP1A2P50993 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP1A2P50993 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP1A2P50993 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP1A2P50993 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP1A2P50993 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP1A2P50993 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP1A2P50993 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP1A2P50993 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP1A2P50993 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP1A2P50993 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP1A2P50993 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP1A2P50993 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP1A2P50993 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP1A2P50993 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP1A2P50993 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP1A2P50993 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP1A2P50993 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP1A2P50993 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP1A2P50993 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP1A2P50993 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP1A2P50993 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP1A2P50993 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP1A2P50993 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP1A2P50993 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP1A2P50993 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP1A2P50993 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP1A2P50993 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP1A2P50993 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP1A2P50993 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP1A2P50993 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP1A2P50993 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP1A2P50993 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP1A2P50993 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP1A2P50993 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP1A2P50993 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP1A2P50993 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP1A2P50993 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP1A2P50993 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP1A2P50993 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP1A2P50993 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP1A2P50993 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP1A2P50993 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP1A2P50993 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP1A2P50993 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP1A2P50993 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP1A2P50993 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP1A2P50993 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP1A2P50993 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP1A2P50993 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP1A2P50993 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP1A2P50993 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP1A2P50993 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP1A2P50993 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP1A2P50993 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP1A2P50993 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP1A2P50993 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP1A2P50993 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP1A2P50993 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP1A2P50993 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP1A2P50993 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP1A2P50993 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP1A2P50993 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP1A2P50993 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP1A2P50993 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP1A2P50993 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP1A2P50993 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP1A2P50993 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP1A2P50993 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP1A2P50993 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP1A2P50993 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP1A2P50993 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP1A2P50993 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP1A2P50993 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP1A2P50993 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP1A2P50993 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP1A2P50993 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP1A2P50993 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP1A2P50993 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP1A2P50993 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP1A2P50993 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP1A2P50993 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP1A2P50993 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP1A2P50993 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP1A2P50993 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP1A2P50993 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP1A2P50993 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms