Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCT8P50990 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCT8P50990 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCT8P50990 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCT8P50990 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCT8P50990 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCT8P50990 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCT8P50990 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCT8P50990 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCT8P50990 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCT8P50990 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCT8P50990 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCT8P50990 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCT8P50990 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCT8P50990 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCT8P50990 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCT8P50990 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCT8P50990 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCT8P50990 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCT8P50990 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCT8P50990 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCT8P50990 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCT8P50990 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCT8P50990 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCT8P50990 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCT8P50990 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCT8P50990 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCT8P50990 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCT8P50990 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCT8P50990 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCT8P50990 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCT8P50990 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCT8P50990 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCT8P50990 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCT8P50990 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCT8P50990 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCT8P50990 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCT8P50990 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCT8P50990 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCT8P50990 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCT8P50990 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCT8P50990 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCT8P50990 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCT8P50990 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCT8P50990 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCT8P50990 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCT8P50990 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCT8P50990 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCT8P50990 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCT8P50990 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCT8P50990 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCT8P50990 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCT8P50990 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCT8P50990 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCT8P50990 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCT8P50990 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCT8P50990 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCT8P50990 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCT8P50990 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCT8P50990 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCT8P50990 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCT8P50990 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCT8P50990 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCT8P50990 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCT8P50990 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCT8P50990 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCT8P50990 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCT8P50990 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCT8P50990 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCT8P50990 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCT8P50990 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCT8P50990 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCT8P50990 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCT8P50990 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCT8P50990 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCT8P50990 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCT8P50990 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCT8P50990 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCT8P50990 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCT8P50990 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCT8P50990 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCT8P50990 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCT8P50990 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCT8P50990 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCT8P50990 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCT8P50990 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCT8P50990 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCT8P50990 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCT8P50990 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCT8P50990 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCT8P50990 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCT8P50990 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCT8P50990 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCT8P50990 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCT8P50990 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCT8P50990 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCT8P50990 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCT8P50990 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCT8P50990 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCT8P50990 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms