Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERFP50548 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERFP50548 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERFP50548 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ERFP50548 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERFP50548 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERFP50548 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERFP50548 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERFP50548 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERFP50548 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERFP50548 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERFP50548 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERFP50548 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERFP50548 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERFP50548 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERFP50548 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERFP50548 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERFP50548 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERFP50548 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERFP50548 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERFP50548 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERFP50548 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERFP50548 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERFP50548 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERFP50548 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERFP50548 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERFP50548 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERFP50548 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERFP50548 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ERFP50548 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERFP50548 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERFP50548 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERFP50548 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERFP50548 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERFP50548 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERFP50548 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERFP50548 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERFP50548 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERFP50548 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERFP50548 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERFP50548 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERFP50548 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERFP50548 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERFP50548 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERFP50548 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERFP50548 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERFP50548 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERFP50548 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERFP50548 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERFP50548 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERFP50548 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERFP50548 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERFP50548 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERFP50548 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERFP50548 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERFP50548 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERFP50548 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERFP50548 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERFP50548 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERFP50548 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERFP50548 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERFP50548 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERFP50548 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERFP50548 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERFP50548 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERFP50548 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERFP50548 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERFP50548 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERFP50548 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERFP50548 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERFP50548 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERFP50548 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERFP50548 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERFP50548 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERFP50548 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERFP50548 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERFP50548 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERFP50548 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERFP50548 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ERFP50548 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERFP50548 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERFP50548 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERFP50548 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERFP50548 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERFP50548 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERFP50548 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERFP50548 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ERFP50548 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERFP50548 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERFP50548 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERFP50548 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERFP50548 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERFP50548 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERFP50548 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERFP50548 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERFP50548 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERFP50548 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERFP50548 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERFP50548 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERFP50548 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.1 ms