Protein–RNA interactions for Protein: P49917

LIG4, DNA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG4P49917 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LIG4P49917 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LIG4P49917 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LIG4P49917 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LIG4P49917 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LIG4P49917 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LIG4P49917 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LIG4P49917 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LIG4P49917 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LIG4P49917 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LIG4P49917 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LIG4P49917 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LIG4P49917 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LIG4P49917 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LIG4P49917 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LIG4P49917 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LIG4P49917 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LIG4P49917 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LIG4P49917 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LIG4P49917 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LIG4P49917 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LIG4P49917 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LIG4P49917 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LIG4P49917 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LIG4P49917 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LIG4P49917 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LIG4P49917 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LIG4P49917 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LIG4P49917 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LIG4P49917 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LIG4P49917 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LIG4P49917 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LIG4P49917 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
LIG4P49917 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
LIG4P49917 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LIG4P49917 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LIG4P49917 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LIG4P49917 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LIG4P49917 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LIG4P49917 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LIG4P49917 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LIG4P49917 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LIG4P49917 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LIG4P49917 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LIG4P49917 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LIG4P49917 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LIG4P49917 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LIG4P49917 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LIG4P49917 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LIG4P49917 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LIG4P49917 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LIG4P49917 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LIG4P49917 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LIG4P49917 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LIG4P49917 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LIG4P49917 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LIG4P49917 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LIG4P49917 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LIG4P49917 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LIG4P49917 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LIG4P49917 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LIG4P49917 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LIG4P49917 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LIG4P49917 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LIG4P49917 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LIG4P49917 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LIG4P49917 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LIG4P49917 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LIG4P49917 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LIG4P49917 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LIG4P49917 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LIG4P49917 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LIG4P49917 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LIG4P49917 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LIG4P49917 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LIG4P49917 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LIG4P49917 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LIG4P49917 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LIG4P49917 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LIG4P49917 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LIG4P49917 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LIG4P49917 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LIG4P49917 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LIG4P49917 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LIG4P49917 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LIG4P49917 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LIG4P49917 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LIG4P49917 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LIG4P49917 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LIG4P49917 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LIG4P49917 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LIG4P49917 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LIG4P49917 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LIG4P49917 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LIG4P49917 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LIG4P49917 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LIG4P49917 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LIG4P49917 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LIG4P49917 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LIG4P49917 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms