Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
NUP153P49790 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
NUP153P49790 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
NUP153P49790 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
NUP153P49790 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
NUP153P49790 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
NUP153P49790 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC37.35■■■■□ 3.57
NUP153P49790 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
NUP153P49790 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC37.35■■■■□ 3.57
NUP153P49790 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
NUP153P49790 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
NUP153P49790 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
NUP153P49790 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
NUP153P49790 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
NUP153P49790 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
NUP153P49790 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
NUP153P49790 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
NUP153P49790 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
NUP153P49790 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
NUP153P49790 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
NUP153P49790 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
NUP153P49790 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
NUP153P49790 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
NUP153P49790 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
NUP153P49790 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
NUP153P49790 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
NUP153P49790 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
NUP153P49790 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
NUP153P49790 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
NUP153P49790 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
NUP153P49790 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
NUP153P49790 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
NUP153P49790 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
NUP153P49790 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
NUP153P49790 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
NUP153P49790 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
NUP153P49790 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
NUP153P49790 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
NUP153P49790 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
NUP153P49790 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
NUP153P49790 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
NUP153P49790 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
NUP153P49790 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC37.27■■■■□ 3.56
NUP153P49790 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
NUP153P49790 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
NUP153P49790 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
NUP153P49790 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
NUP153P49790 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC37.26■■■■□ 3.55
NUP153P49790 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
NUP153P49790 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
NUP153P49790 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
NUP153P49790 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
NUP153P49790 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
NUP153P49790 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
NUP153P49790 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
NUP153P49790 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
NUP153P49790 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
NUP153P49790 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
NUP153P49790 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
NUP153P49790 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
NUP153P49790 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
NUP153P49790 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
NUP153P49790 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
NUP153P49790 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
NUP153P49790 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
NUP153P49790 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
NUP153P49790 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
NUP153P49790 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.54
NUP153P49790 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.54
NUP153P49790 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.54
NUP153P49790 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
NUP153P49790 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
NUP153P49790 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
NUP153P49790 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
NUP153P49790 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
NUP153P49790 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
NUP153P49790 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
NUP153P49790 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
NUP153P49790 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
NUP153P49790 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
NUP153P49790 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
NUP153P49790 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
NUP153P49790 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
NUP153P49790 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
NUP153P49790 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
NUP153P49790 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
NUP153P49790 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
NUP153P49790 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
NUP153P49790 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
NUP153P49790 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
NUP153P49790 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
NUP153P49790 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
NUP153P49790 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
NUP153P49790 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
NUP153P49790 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
NUP153P49790 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
NUP153P49790 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.54
NUP153P49790 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC37.13■■■■□ 3.54
NUP153P49790 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
NUP153P49790 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms