Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTPAP49638 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTPAP49638 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTPAP49638 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTPAP49638 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTPAP49638 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTPAP49638 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTPAP49638 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTPAP49638 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTPAP49638 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTPAP49638 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTPAP49638 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTPAP49638 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTPAP49638 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTPAP49638 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTPAP49638 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTPAP49638 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTPAP49638 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTPAP49638 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTPAP49638 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTPAP49638 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTPAP49638 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTPAP49638 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTPAP49638 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTPAP49638 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTPAP49638 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTPAP49638 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTPAP49638 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTPAP49638 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTPAP49638 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTPAP49638 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTPAP49638 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTPAP49638 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTPAP49638 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTPAP49638 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TTPAP49638 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTPAP49638 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTPAP49638 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTPAP49638 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTPAP49638 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTPAP49638 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTPAP49638 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTPAP49638 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTPAP49638 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTPAP49638 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTPAP49638 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTPAP49638 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTPAP49638 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTPAP49638 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTPAP49638 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTPAP49638 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTPAP49638 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTPAP49638 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTPAP49638 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTPAP49638 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTPAP49638 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTPAP49638 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTPAP49638 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTPAP49638 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTPAP49638 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTPAP49638 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTPAP49638 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTPAP49638 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTPAP49638 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTPAP49638 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTPAP49638 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTPAP49638 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTPAP49638 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTPAP49638 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTPAP49638 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTPAP49638 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTPAP49638 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTPAP49638 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTPAP49638 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTPAP49638 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTPAP49638 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTPAP49638 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTPAP49638 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TTPAP49638 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTPAP49638 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TTPAP49638 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTPAP49638 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTPAP49638 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTPAP49638 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TTPAP49638 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTPAP49638 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TTPAP49638 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TTPAP49638 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TTPAP49638 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TTPAP49638 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TTPAP49638 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTPAP49638 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTPAP49638 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTPAP49638 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTPAP49638 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTPAP49638 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTPAP49638 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TTPAP49638 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTPAP49638 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTPAP49638 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
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