Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FNTAP49354 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FNTAP49354 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FNTAP49354 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FNTAP49354 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FNTAP49354 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FNTAP49354 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FNTAP49354 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FNTAP49354 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FNTAP49354 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FNTAP49354 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FNTAP49354 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FNTAP49354 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FNTAP49354 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FNTAP49354 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FNTAP49354 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FNTAP49354 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FNTAP49354 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FNTAP49354 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FNTAP49354 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FNTAP49354 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FNTAP49354 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FNTAP49354 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FNTAP49354 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FNTAP49354 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FNTAP49354 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FNTAP49354 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FNTAP49354 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FNTAP49354 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FNTAP49354 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FNTAP49354 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FNTAP49354 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FNTAP49354 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FNTAP49354 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FNTAP49354 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FNTAP49354 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FNTAP49354 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FNTAP49354 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FNTAP49354 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FNTAP49354 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FNTAP49354 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FNTAP49354 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FNTAP49354 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FNTAP49354 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FNTAP49354 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FNTAP49354 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FNTAP49354 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FNTAP49354 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FNTAP49354 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FNTAP49354 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FNTAP49354 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FNTAP49354 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FNTAP49354 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FNTAP49354 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FNTAP49354 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FNTAP49354 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FNTAP49354 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FNTAP49354 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FNTAP49354 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FNTAP49354 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FNTAP49354 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FNTAP49354 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FNTAP49354 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FNTAP49354 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FNTAP49354 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FNTAP49354 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FNTAP49354 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FNTAP49354 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FNTAP49354 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FNTAP49354 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FNTAP49354 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FNTAP49354 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FNTAP49354 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FNTAP49354 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FNTAP49354 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FNTAP49354 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FNTAP49354 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FNTAP49354 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FNTAP49354 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FNTAP49354 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FNTAP49354 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FNTAP49354 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FNTAP49354 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FNTAP49354 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FNTAP49354 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FNTAP49354 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FNTAP49354 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FNTAP49354 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FNTAP49354 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FNTAP49354 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FNTAP49354 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FNTAP49354 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FNTAP49354 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FNTAP49354 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FNTAP49354 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FNTAP49354 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FNTAP49354 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FNTAP49354 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FNTAP49354 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FNTAP49354 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms