Protein–RNA interactions for Protein: P48443

RXRG, Retinoic acid receptor RXR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRGP48443 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RXRGP48443 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RXRGP48443 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.35
RXRGP48443 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RXRGP48443 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RXRGP48443 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RXRGP48443 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RXRGP48443 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RXRGP48443 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RXRGP48443 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RXRGP48443 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RXRGP48443 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RXRGP48443 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RXRGP48443 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RXRGP48443 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RXRGP48443 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RXRGP48443 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RXRGP48443 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RXRGP48443 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RXRGP48443 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RXRGP48443 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RXRGP48443 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RXRGP48443 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RXRGP48443 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RXRGP48443 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RXRGP48443 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RXRGP48443 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RXRGP48443 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RXRGP48443 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RXRGP48443 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RXRGP48443 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RXRGP48443 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RXRGP48443 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RXRGP48443 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RXRGP48443 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RXRGP48443 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RXRGP48443 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RXRGP48443 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RXRGP48443 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RXRGP48443 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RXRGP48443 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RXRGP48443 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RXRGP48443 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RXRGP48443 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RXRGP48443 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RXRGP48443 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RXRGP48443 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RXRGP48443 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RXRGP48443 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RXRGP48443 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RXRGP48443 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RXRGP48443 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RXRGP48443 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RXRGP48443 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RXRGP48443 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RXRGP48443 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RXRGP48443 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RXRGP48443 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RXRGP48443 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RXRGP48443 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RXRGP48443 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RXRGP48443 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RXRGP48443 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RXRGP48443 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RXRGP48443 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RXRGP48443 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RXRGP48443 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RXRGP48443 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RXRGP48443 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RXRGP48443 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RXRGP48443 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RXRGP48443 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RXRGP48443 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RXRGP48443 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RXRGP48443 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RXRGP48443 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RXRGP48443 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RXRGP48443 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RXRGP48443 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RXRGP48443 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RXRGP48443 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RXRGP48443 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RXRGP48443 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RXRGP48443 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RXRGP48443 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RXRGP48443 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RXRGP48443 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RXRGP48443 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RXRGP48443 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RXRGP48443 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RXRGP48443 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RXRGP48443 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RXRGP48443 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RXRGP48443 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RXRGP48443 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RXRGP48443 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RXRGP48443 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RXRGP48443 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RXRGP48443 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RXRGP48443 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms