Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRA4P48169 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRA4P48169 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRA4P48169 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRA4P48169 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRA4P48169 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRA4P48169 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRA4P48169 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRA4P48169 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRA4P48169 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRA4P48169 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRA4P48169 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRA4P48169 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRA4P48169 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRA4P48169 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRA4P48169 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRA4P48169 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRA4P48169 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRA4P48169 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRA4P48169 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRA4P48169 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRA4P48169 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRA4P48169 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRA4P48169 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRA4P48169 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRA4P48169 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRA4P48169 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRA4P48169 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRA4P48169 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRA4P48169 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRA4P48169 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRA4P48169 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRA4P48169 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRA4P48169 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRA4P48169 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRA4P48169 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRA4P48169 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRA4P48169 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRA4P48169 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRA4P48169 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.7 ms