Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIA4P48058 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIA4P48058 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIA4P48058 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIA4P48058 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIA4P48058 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIA4P48058 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIA4P48058 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIA4P48058 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIA4P48058 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIA4P48058 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIA4P48058 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIA4P48058 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIA4P48058 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIA4P48058 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIA4P48058 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIA4P48058 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIA4P48058 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIA4P48058 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIA4P48058 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIA4P48058 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIA4P48058 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIA4P48058 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIA4P48058 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIA4P48058 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIA4P48058 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIA4P48058 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIA4P48058 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIA4P48058 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIA4P48058 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIA4P48058 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIA4P48058 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIA4P48058 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIA4P48058 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIA4P48058 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIA4P48058 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIA4P48058 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIA4P48058 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIA4P48058 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIA4P48058 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIA4P48058 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIA4P48058 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIA4P48058 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIA4P48058 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIA4P48058 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GRIA4P48058 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GRIA4P48058 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIA4P48058 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIA4P48058 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIA4P48058 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIA4P48058 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIA4P48058 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIA4P48058 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIA4P48058 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIA4P48058 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIA4P48058 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIA4P48058 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIA4P48058 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIA4P48058 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIA4P48058 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIA4P48058 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIA4P48058 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIA4P48058 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIA4P48058 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIA4P48058 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIA4P48058 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIA4P48058 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIA4P48058 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIA4P48058 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIA4P48058 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIA4P48058 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIA4P48058 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIA4P48058 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIA4P48058 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIA4P48058 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIA4P48058 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIA4P48058 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIA4P48058 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIA4P48058 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIA4P48058 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIA4P48058 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIA4P48058 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIA4P48058 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIA4P48058 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIA4P48058 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIA4P48058 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIA4P48058 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIA4P48058 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIA4P48058 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIA4P48058 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIA4P48058 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIA4P48058 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIA4P48058 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIA4P48058 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIA4P48058 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIA4P48058 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIA4P48058 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIA4P48058 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIA4P48058 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIA4P48058 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms