Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TMPOP42166 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TMPOP42166 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TMPOP42166 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TMPOP42166 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TMPOP42166 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TMPOP42166 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TMPOP42166 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TMPOP42166 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TMPOP42166 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
TMPOP42166 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TMPOP42166 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TMPOP42166 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TMPOP42166 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TMPOP42166 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TMPOP42166 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TMPOP42166 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TMPOP42166 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TMPOP42166 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TMPOP42166 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TMPOP42166 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TMPOP42166 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TMPOP42166 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TMPOP42166 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TMPOP42166 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TMPOP42166 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TMPOP42166 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TMPOP42166 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TMPOP42166 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TMPOP42166 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TMPOP42166 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TMPOP42166 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TMPOP42166 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TMPOP42166 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
TMPOP42166 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TMPOP42166 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TMPOP42166 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TMPOP42166 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TMPOP42166 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TMPOP42166 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TMPOP42166 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TMPOP42166 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TMPOP42166 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
TMPOP42166 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TMPOP42166 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TMPOP42166 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TMPOP42166 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TMPOP42166 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TMPOP42166 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TMPOP42166 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
TMPOP42166 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TMPOP42166 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TMPOP42166 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
TMPOP42166 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
TMPOP42166 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TMPOP42166 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TMPOP42166 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
TMPOP42166 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TMPOP42166 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
TMPOP42166 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC31■■■□□ 2.55
TMPOP42166 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TMPOP42166 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TMPOP42166 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TMPOP42166 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TMPOP42166 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TMPOP42166 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TMPOP42166 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TMPOP42166 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TMPOP42166 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TMPOP42166 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TMPOP42166 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TMPOP42166 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TMPOP42166 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TMPOP42166 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TMPOP42166 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TMPOP42166 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TMPOP42166 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TMPOP42166 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TMPOP42166 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TMPOP42166 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TMPOP42166 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TMPOP42166 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TMPOP42166 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TMPOP42166 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TMPOP42166 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TMPOP42166 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
TMPOP42166 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
TMPOP42166 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.54
TMPOP42166 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
TMPOP42166 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
TMPOP42166 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
TMPOP42166 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TMPOP42166 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TMPOP42166 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
TMPOP42166 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TMPOP42166 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TMPOP42166 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TMPOP42166 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TMPOP42166 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TMPOP42166 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms