Protein–RNA interactions for Protein: P40879

SLC26A3, Chloride anion exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A3P40879 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC26A3P40879 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC26A3P40879 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC26A3P40879 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC26A3P40879 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC26A3P40879 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC26A3P40879 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC26A3P40879 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC26A3P40879 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC26A3P40879 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC26A3P40879 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC26A3P40879 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC26A3P40879 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC26A3P40879 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC26A3P40879 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC26A3P40879 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC26A3P40879 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC26A3P40879 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC26A3P40879 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC26A3P40879 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC26A3P40879 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC26A3P40879 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC26A3P40879 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC26A3P40879 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC26A3P40879 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC26A3P40879 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC26A3P40879 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC26A3P40879 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC26A3P40879 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC26A3P40879 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC26A3P40879 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC26A3P40879 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC26A3P40879 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC26A3P40879 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC26A3P40879 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SLC26A3P40879 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SLC26A3P40879 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC26A3P40879 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC26A3P40879 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC26A3P40879 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC26A3P40879 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC26A3P40879 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC26A3P40879 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC26A3P40879 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC26A3P40879 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC26A3P40879 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC26A3P40879 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC26A3P40879 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC26A3P40879 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC26A3P40879 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC26A3P40879 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC26A3P40879 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC26A3P40879 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC26A3P40879 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC26A3P40879 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC26A3P40879 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC26A3P40879 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC26A3P40879 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC26A3P40879 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC26A3P40879 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC26A3P40879 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC26A3P40879 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC26A3P40879 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC26A3P40879 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC26A3P40879 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC26A3P40879 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC26A3P40879 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC26A3P40879 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC26A3P40879 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC26A3P40879 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC26A3P40879 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC26A3P40879 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC26A3P40879 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC26A3P40879 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC26A3P40879 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC26A3P40879 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC26A3P40879 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC26A3P40879 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC26A3P40879 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC26A3P40879 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC26A3P40879 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC26A3P40879 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC26A3P40879 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC26A3P40879 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC26A3P40879 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC26A3P40879 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC26A3P40879 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC26A3P40879 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC26A3P40879 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC26A3P40879 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC26A3P40879 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC26A3P40879 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC26A3P40879 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC26A3P40879 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC26A3P40879 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC26A3P40879 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC26A3P40879 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC26A3P40879 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC26A3P40879 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC26A3P40879 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms