Protein–RNA interactions for Protein: P40617

ARL4A, ADP-ribosylation factor-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4AP40617 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARL4AP40617 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ARL4AP40617 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARL4AP40617 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARL4AP40617 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARL4AP40617 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARL4AP40617 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ARL4AP40617 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARL4AP40617 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARL4AP40617 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ARL4AP40617 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARL4AP40617 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARL4AP40617 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARL4AP40617 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARL4AP40617 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARL4AP40617 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARL4AP40617 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARL4AP40617 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARL4AP40617 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARL4AP40617 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARL4AP40617 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARL4AP40617 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARL4AP40617 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARL4AP40617 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARL4AP40617 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARL4AP40617 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARL4AP40617 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARL4AP40617 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARL4AP40617 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARL4AP40617 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARL4AP40617 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARL4AP40617 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARL4AP40617 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARL4AP40617 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARL4AP40617 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARL4AP40617 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARL4AP40617 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARL4AP40617 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARL4AP40617 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ARL4AP40617 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARL4AP40617 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARL4AP40617 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARL4AP40617 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARL4AP40617 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARL4AP40617 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARL4AP40617 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARL4AP40617 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ARL4AP40617 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARL4AP40617 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARL4AP40617 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARL4AP40617 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARL4AP40617 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARL4AP40617 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARL4AP40617 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARL4AP40617 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARL4AP40617 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARL4AP40617 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARL4AP40617 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARL4AP40617 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARL4AP40617 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARL4AP40617 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARL4AP40617 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARL4AP40617 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARL4AP40617 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARL4AP40617 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARL4AP40617 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARL4AP40617 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARL4AP40617 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARL4AP40617 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARL4AP40617 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARL4AP40617 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARL4AP40617 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARL4AP40617 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARL4AP40617 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ARL4AP40617 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ARL4AP40617 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ARL4AP40617 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARL4AP40617 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARL4AP40617 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ARL4AP40617 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARL4AP40617 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARL4AP40617 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARL4AP40617 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARL4AP40617 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARL4AP40617 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARL4AP40617 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARL4AP40617 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARL4AP40617 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARL4AP40617 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARL4AP40617 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARL4AP40617 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARL4AP40617 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARL4AP40617 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARL4AP40617 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARL4AP40617 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARL4AP40617 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ARL4AP40617 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARL4AP40617 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARL4AP40617 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARL4AP40617 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms