Protein–RNA interactions for Protein: P40198

CEACAM3, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM3P40198 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEACAM3P40198 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEACAM3P40198 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEACAM3P40198 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEACAM3P40198 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEACAM3P40198 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CEACAM3P40198 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEACAM3P40198 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CEACAM3P40198 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEACAM3P40198 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEACAM3P40198 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEACAM3P40198 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEACAM3P40198 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEACAM3P40198 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEACAM3P40198 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEACAM3P40198 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEACAM3P40198 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEACAM3P40198 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEACAM3P40198 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEACAM3P40198 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEACAM3P40198 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEACAM3P40198 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEACAM3P40198 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEACAM3P40198 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEACAM3P40198 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CEACAM3P40198 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEACAM3P40198 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEACAM3P40198 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEACAM3P40198 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEACAM3P40198 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEACAM3P40198 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEACAM3P40198 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEACAM3P40198 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEACAM3P40198 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEACAM3P40198 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEACAM3P40198 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CEACAM3P40198 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CEACAM3P40198 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CEACAM3P40198 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CEACAM3P40198 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CEACAM3P40198 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CEACAM3P40198 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CEACAM3P40198 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CEACAM3P40198 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CEACAM3P40198 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CEACAM3P40198 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CEACAM3P40198 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CEACAM3P40198 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CEACAM3P40198 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEACAM3P40198 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEACAM3P40198 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEACAM3P40198 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEACAM3P40198 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEACAM3P40198 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CEACAM3P40198 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEACAM3P40198 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEACAM3P40198 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEACAM3P40198 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEACAM3P40198 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEACAM3P40198 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEACAM3P40198 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEACAM3P40198 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEACAM3P40198 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEACAM3P40198 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEACAM3P40198 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEACAM3P40198 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEACAM3P40198 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEACAM3P40198 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEACAM3P40198 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEACAM3P40198 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEACAM3P40198 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEACAM3P40198 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEACAM3P40198 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEACAM3P40198 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEACAM3P40198 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CEACAM3P40198 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CEACAM3P40198 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEACAM3P40198 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEACAM3P40198 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEACAM3P40198 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CEACAM3P40198 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CEACAM3P40198 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CEACAM3P40198 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CEACAM3P40198 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CEACAM3P40198 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CEACAM3P40198 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CEACAM3P40198 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CEACAM3P40198 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CEACAM3P40198 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CEACAM3P40198 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CEACAM3P40198 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CEACAM3P40198 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CEACAM3P40198 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CEACAM3P40198 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CEACAM3P40198 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CEACAM3P40198 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CEACAM3P40198 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CEACAM3P40198 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CEACAM3P40198 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CEACAM3P40198 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms