Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHRNA7P36544 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA7P36544 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms