Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDIT3P35638 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDIT3P35638 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDIT3P35638 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDIT3P35638 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDIT3P35638 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDIT3P35638 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDIT3P35638 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDIT3P35638 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDIT3P35638 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
DDIT3P35638 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDIT3P35638 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDIT3P35638 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDIT3P35638 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDIT3P35638 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDIT3P35638 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDIT3P35638 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDIT3P35638 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDIT3P35638 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDIT3P35638 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDIT3P35638 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDIT3P35638 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDIT3P35638 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDIT3P35638 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDIT3P35638 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDIT3P35638 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDIT3P35638 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDIT3P35638 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDIT3P35638 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDIT3P35638 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDIT3P35638 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDIT3P35638 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDIT3P35638 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDIT3P35638 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDIT3P35638 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDIT3P35638 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
DDIT3P35638 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDIT3P35638 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDIT3P35638 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDIT3P35638 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDIT3P35638 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDIT3P35638 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDIT3P35638 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDIT3P35638 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDIT3P35638 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDIT3P35638 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
DDIT3P35638 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
DDIT3P35638 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
DDIT3P35638 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDIT3P35638 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDIT3P35638 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDIT3P35638 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDIT3P35638 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDIT3P35638 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDIT3P35638 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDIT3P35638 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDIT3P35638 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDIT3P35638 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDIT3P35638 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDIT3P35638 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDIT3P35638 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDIT3P35638 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDIT3P35638 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDIT3P35638 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDIT3P35638 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDIT3P35638 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDIT3P35638 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDIT3P35638 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDIT3P35638 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
DDIT3P35638 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
DDIT3P35638 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDIT3P35638 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDIT3P35638 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDIT3P35638 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDIT3P35638 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDIT3P35638 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDIT3P35638 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDIT3P35638 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDIT3P35638 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDIT3P35638 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDIT3P35638 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
DDIT3P35638 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDIT3P35638 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDIT3P35638 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDIT3P35638 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDIT3P35638 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDIT3P35638 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDIT3P35638 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDIT3P35638 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDIT3P35638 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDIT3P35638 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDIT3P35638 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDIT3P35638 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDIT3P35638 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
DDIT3P35638 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDIT3P35638 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDIT3P35638 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDIT3P35638 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDIT3P35638 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDIT3P35638 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms