Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCGF2P35227 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCGF2P35227 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCGF2P35227 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCGF2P35227 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCGF2P35227 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCGF2P35227 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCGF2P35227 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCGF2P35227 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCGF2P35227 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCGF2P35227 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCGF2P35227 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCGF2P35227 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCGF2P35227 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCGF2P35227 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PCGF2P35227 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PCGF2P35227 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCGF2P35227 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCGF2P35227 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCGF2P35227 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCGF2P35227 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCGF2P35227 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCGF2P35227 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCGF2P35227 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCGF2P35227 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCGF2P35227 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCGF2P35227 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCGF2P35227 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCGF2P35227 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCGF2P35227 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCGF2P35227 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCGF2P35227 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCGF2P35227 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCGF2P35227 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCGF2P35227 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCGF2P35227 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCGF2P35227 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCGF2P35227 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PCGF2P35227 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCGF2P35227 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCGF2P35227 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCGF2P35227 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCGF2P35227 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCGF2P35227 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCGF2P35227 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PCGF2P35227 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCGF2P35227 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCGF2P35227 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCGF2P35227 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCGF2P35227 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCGF2P35227 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCGF2P35227 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCGF2P35227 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCGF2P35227 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCGF2P35227 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCGF2P35227 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCGF2P35227 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCGF2P35227 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCGF2P35227 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCGF2P35227 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCGF2P35227 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCGF2P35227 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCGF2P35227 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCGF2P35227 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCGF2P35227 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PCGF2P35227 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCGF2P35227 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCGF2P35227 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCGF2P35227 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCGF2P35227 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCGF2P35227 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCGF2P35227 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCGF2P35227 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCGF2P35227 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCGF2P35227 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCGF2P35227 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCGF2P35227 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCGF2P35227 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCGF2P35227 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCGF2P35227 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCGF2P35227 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCGF2P35227 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCGF2P35227 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCGF2P35227 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCGF2P35227 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PCGF2P35227 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCGF2P35227 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCGF2P35227 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCGF2P35227 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCGF2P35227 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PCGF2P35227 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCGF2P35227 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PCGF2P35227 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCGF2P35227 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCGF2P35227 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCGF2P35227 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCGF2P35227 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCGF2P35227 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCGF2P35227 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCGF2P35227 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms