Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NTF4P34130 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NTF4P34130 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NTF4P34130 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NTF4P34130 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NTF4P34130 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NTF4P34130 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NTF4P34130 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NTF4P34130 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NTF4P34130 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NTF4P34130 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NTF4P34130 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NTF4P34130 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NTF4P34130 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
NTF4P34130 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NTF4P34130 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NTF4P34130 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NTF4P34130 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NTF4P34130 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NTF4P34130 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NTF4P34130 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NTF4P34130 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NTF4P34130 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NTF4P34130 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NTF4P34130 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NTF4P34130 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NTF4P34130 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NTF4P34130 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NTF4P34130 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NTF4P34130 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NTF4P34130 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NTF4P34130 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NTF4P34130 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NTF4P34130 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NTF4P34130 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NTF4P34130 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NTF4P34130 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NTF4P34130 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NTF4P34130 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NTF4P34130 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NTF4P34130 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NTF4P34130 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NTF4P34130 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NTF4P34130 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NTF4P34130 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NTF4P34130 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NTF4P34130 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NTF4P34130 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NTF4P34130 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NTF4P34130 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NTF4P34130 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTF4P34130 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTF4P34130 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTF4P34130 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTF4P34130 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NTF4P34130 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTF4P34130 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTF4P34130 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NTF4P34130 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTF4P34130 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTF4P34130 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTF4P34130 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTF4P34130 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTF4P34130 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NTF4P34130 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NTF4P34130 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NTF4P34130 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NTF4P34130 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NTF4P34130 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NTF4P34130 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NTF4P34130 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NTF4P34130 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NTF4P34130 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NTF4P34130 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NTF4P34130 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NTF4P34130 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NTF4P34130 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NTF4P34130 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NTF4P34130 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NTF4P34130 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NTF4P34130 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NTF4P34130 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NTF4P34130 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NTF4P34130 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NTF4P34130 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NTF4P34130 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NTF4P34130 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NTF4P34130 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NTF4P34130 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NTF4P34130 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NTF4P34130 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NTF4P34130 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NTF4P34130 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NTF4P34130 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NTF4P34130 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NTF4P34130 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NTF4P34130 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NTF4P34130 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NTF4P34130 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NTF4P34130 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms