Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMPK1P30085 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CMPK1P30085 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMPK1P30085 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMPK1P30085 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMPK1P30085 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMPK1P30085 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMPK1P30085 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMPK1P30085 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMPK1P30085 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMPK1P30085 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMPK1P30085 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMPK1P30085 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMPK1P30085 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMPK1P30085 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMPK1P30085 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMPK1P30085 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMPK1P30085 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMPK1P30085 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMPK1P30085 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMPK1P30085 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMPK1P30085 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CMPK1P30085 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CMPK1P30085 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CMPK1P30085 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CMPK1P30085 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CMPK1P30085 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CMPK1P30085 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CMPK1P30085 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CMPK1P30085 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CMPK1P30085 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CMPK1P30085 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMPK1P30085 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMPK1P30085 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMPK1P30085 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMPK1P30085 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMPK1P30085 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMPK1P30085 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMPK1P30085 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMPK1P30085 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CMPK1P30085 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CMPK1P30085 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CMPK1P30085 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CMPK1P30085 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CMPK1P30085 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CMPK1P30085 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CMPK1P30085 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CMPK1P30085 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CMPK1P30085 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CMPK1P30085 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CMPK1P30085 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CMPK1P30085 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CMPK1P30085 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CMPK1P30085 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CMPK1P30085 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CMPK1P30085 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CMPK1P30085 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CMPK1P30085 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CMPK1P30085 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CMPK1P30085 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CMPK1P30085 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CMPK1P30085 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CMPK1P30085 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CMPK1P30085 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CMPK1P30085 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CMPK1P30085 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CMPK1P30085 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CMPK1P30085 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CMPK1P30085 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CMPK1P30085 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CMPK1P30085 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CMPK1P30085 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CMPK1P30085 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CMPK1P30085 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms