Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
PTPRMP28827 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
PTPRMP28827 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
PTPRMP28827 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
PTPRMP28827 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PTPRMP28827 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PTPRMP28827 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PTPRMP28827 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PTPRMP28827 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
PTPRMP28827 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PTPRMP28827 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PTPRMP28827 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PTPRMP28827 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PTPRMP28827 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PTPRMP28827 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PTPRMP28827 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PTPRMP28827 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
PTPRMP28827 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PTPRMP28827 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
PTPRMP28827 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
PTPRMP28827 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
PTPRMP28827 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PTPRMP28827 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PTPRMP28827 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PTPRMP28827 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PTPRMP28827 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PTPRMP28827 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
PTPRMP28827 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PTPRMP28827 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PTPRMP28827 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PTPRMP28827 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PTPRMP28827 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PTPRMP28827 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PTPRMP28827 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC35.34■■■■□ 3.25
PTPRMP28827 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC35.33■■■■□ 3.25
PTPRMP28827 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
PTPRMP28827 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC35.33■■■■□ 3.25
PTPRMP28827 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
PTPRMP28827 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
PTPRMP28827 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
PTPRMP28827 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC35.32■■■■□ 3.24
PTPRMP28827 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
PTPRMP28827 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
PTPRMP28827 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PTPRMP28827 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PTPRMP28827 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PTPRMP28827 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PTPRMP28827 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
PTPRMP28827 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PTPRMP28827 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PTPRMP28827 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PTPRMP28827 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PTPRMP28827 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PTPRMP28827 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
PTPRMP28827 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC35.29■■■■□ 3.24
PTPRMP28827 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
PTPRMP28827 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PTPRMP28827 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PTPRMP28827 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PTPRMP28827 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
PTPRMP28827 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PTPRMP28827 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PTPRMP28827 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
PTPRMP28827 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
PTPRMP28827 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
PTPRMP28827 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC35.26■■■■□ 3.23
PTPRMP28827 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.23
PTPRMP28827 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
PTPRMP28827 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
PTPRMP28827 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC35.26■■■■□ 3.23
PTPRMP28827 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
PTPRMP28827 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PTPRMP28827 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
PTPRMP28827 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PTPRMP28827 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PTPRMP28827 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PTPRMP28827 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PTPRMP28827 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
PTPRMP28827 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
PTPRMP28827 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
PTPRMP28827 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
PTPRMP28827 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PTPRMP28827 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PTPRMP28827 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PTPRMP28827 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
PTPRMP28827 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PTPRMP28827 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PTPRMP28827 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
PTPRMP28827 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PTPRMP28827 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
PTPRMP28827 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
PTPRMP28827 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
PTPRMP28827 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
PTPRMP28827 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
PTPRMP28827 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
PTPRMP28827 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PTPRMP28827 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PTPRMP28827 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PTPRMP28827 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PTPRMP28827 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
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