Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCAP28676 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCAP28676 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCAP28676 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCAP28676 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCAP28676 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GCAP28676 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCAP28676 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCAP28676 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCAP28676 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCAP28676 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCAP28676 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCAP28676 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCAP28676 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCAP28676 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCAP28676 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCAP28676 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GCAP28676 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GCAP28676 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCAP28676 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCAP28676 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCAP28676 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCAP28676 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCAP28676 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCAP28676 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCAP28676 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCAP28676 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCAP28676 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCAP28676 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCAP28676 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCAP28676 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCAP28676 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCAP28676 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCAP28676 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCAP28676 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCAP28676 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GCAP28676 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCAP28676 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCAP28676 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCAP28676 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCAP28676 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCAP28676 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCAP28676 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCAP28676 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCAP28676 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCAP28676 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCAP28676 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GCAP28676 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCAP28676 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCAP28676 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GCAP28676 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCAP28676 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCAP28676 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCAP28676 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCAP28676 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCAP28676 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCAP28676 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCAP28676 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCAP28676 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCAP28676 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCAP28676 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCAP28676 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCAP28676 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCAP28676 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCAP28676 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCAP28676 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCAP28676 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCAP28676 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCAP28676 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCAP28676 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCAP28676 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCAP28676 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCAP28676 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCAP28676 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCAP28676 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCAP28676 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCAP28676 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCAP28676 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCAP28676 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCAP28676 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCAP28676 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCAP28676 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GCAP28676 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GCAP28676 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GCAP28676 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GCAP28676 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GCAP28676 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GCAP28676 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GCAP28676 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GCAP28676 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GCAP28676 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GCAP28676 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GCAP28676 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCAP28676 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCAP28676 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCAP28676 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCAP28676 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCAP28676 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCAP28676 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCAP28676 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms