Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRB3P28472 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRB3P28472 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRB3P28472 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRB3P28472 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRB3P28472 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRB3P28472 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRB3P28472 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRB3P28472 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRB3P28472 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRB3P28472 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRB3P28472 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRB3P28472 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRB3P28472 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRB3P28472 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRB3P28472 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRB3P28472 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRB3P28472 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRB3P28472 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRB3P28472 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRB3P28472 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRB3P28472 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRB3P28472 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRB3P28472 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRB3P28472 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRB3P28472 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRB3P28472 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRB3P28472 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRB3P28472 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRB3P28472 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRB3P28472 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRB3P28472 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRB3P28472 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRB3P28472 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRB3P28472 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRB3P28472 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRB3P28472 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRB3P28472 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRB3P28472 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRB3P28472 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRB3P28472 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRB3P28472 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRB3P28472 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRB3P28472 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRB3P28472 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRB3P28472 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRB3P28472 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRB3P28472 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GABRB3P28472 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABRB3P28472 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABRB3P28472 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABRB3P28472 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABRB3P28472 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABRB3P28472 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABRB3P28472 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABRB3P28472 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABRB3P28472 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABRB3P28472 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABRB3P28472 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRB3P28472 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRB3P28472 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRB3P28472 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRB3P28472 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABRB3P28472 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABRB3P28472 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABRB3P28472 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABRB3P28472 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GABRB3P28472 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRB3P28472 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRB3P28472 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRB3P28472 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRB3P28472 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRB3P28472 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRB3P28472 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRB3P28472 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRB3P28472 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRB3P28472 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRB3P28472 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRB3P28472 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRB3P28472 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRB3P28472 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRB3P28472 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRB3P28472 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRB3P28472 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRB3P28472 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRB3P28472 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRB3P28472 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRB3P28472 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRB3P28472 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRB3P28472 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRB3P28472 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRB3P28472 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRB3P28472 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GABRB3P28472 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GABRB3P28472 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GABRB3P28472 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GABRB3P28472 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GABRB3P28472 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GABRB3P28472 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABRB3P28472 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms