Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTR2AP28223 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTR2AP28223 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTR2AP28223 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTR2AP28223 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTR2AP28223 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTR2AP28223 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTR2AP28223 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTR2AP28223 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTR2AP28223 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTR2AP28223 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTR2AP28223 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTR2AP28223 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTR2AP28223 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTR2AP28223 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTR2AP28223 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTR2AP28223 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTR2AP28223 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTR2AP28223 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTR2AP28223 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTR2AP28223 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTR2AP28223 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HTR2AP28223 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HTR2AP28223 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HTR2AP28223 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HTR2AP28223 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HTR2AP28223 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HTR2AP28223 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HTR2AP28223 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HTR2AP28223 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HTR2AP28223 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HTR2AP28223 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HTR2AP28223 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HTR2AP28223 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HTR2AP28223 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HTR2AP28223 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HTR2AP28223 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HTR2AP28223 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HTR2AP28223 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HTR2AP28223 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HTR2AP28223 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HTR2AP28223 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HTR2AP28223 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HTR2AP28223 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HTR2AP28223 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HTR2AP28223 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HTR2AP28223 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HTR2AP28223 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HTR2AP28223 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HTR2AP28223 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HTR2AP28223 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HTR2AP28223 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HTR2AP28223 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HTR2AP28223 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HTR2AP28223 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HTR2AP28223 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HTR2AP28223 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HTR2AP28223 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HTR2AP28223 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HTR2AP28223 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HTR2AP28223 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HTR2AP28223 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HTR2AP28223 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HTR2AP28223 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HTR2AP28223 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HTR2AP28223 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HTR2AP28223 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HTR2AP28223 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HTR2AP28223 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HTR2AP28223 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HTR2AP28223 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HTR2AP28223 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HTR2AP28223 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HTR2AP28223 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HTR2AP28223 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HTR2AP28223 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HTR2AP28223 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HTR2AP28223 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HTR2AP28223 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HTR2AP28223 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HTR2AP28223 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HTR2AP28223 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HTR2AP28223 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HTR2AP28223 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HTR2AP28223 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HTR2AP28223 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HTR2AP28223 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HTR2AP28223 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HTR2AP28223 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HTR2AP28223 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HTR2AP28223 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HTR2AP28223 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HTR2AP28223 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HTR2AP28223 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HTR2AP28223 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HTR2AP28223 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HTR2AP28223 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HTR2AP28223 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HTR2AP28223 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HTR2AP28223 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms