Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNTFRP26992 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNTFRP26992 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CNTFRP26992 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNTFRP26992 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNTFRP26992 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNTFRP26992 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNTFRP26992 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNTFRP26992 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNTFRP26992 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNTFRP26992 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTFRP26992 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTFRP26992 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTFRP26992 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTFRP26992 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTFRP26992 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTFRP26992 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTFRP26992 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTFRP26992 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTFRP26992 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNTFRP26992 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTFRP26992 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTFRP26992 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTFRP26992 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTFRP26992 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTFRP26992 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTFRP26992 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTFRP26992 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTFRP26992 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTFRP26992 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTFRP26992 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTFRP26992 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTFRP26992 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTFRP26992 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTFRP26992 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTFRP26992 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTFRP26992 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTFRP26992 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTFRP26992 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTFRP26992 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTFRP26992 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTFRP26992 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNTFRP26992 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CNTFRP26992 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNTFRP26992 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNTFRP26992 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CNTFRP26992 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNTFRP26992 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNTFRP26992 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNTFRP26992 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNTFRP26992 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNTFRP26992 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNTFRP26992 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNTFRP26992 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNTFRP26992 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNTFRP26992 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNTFRP26992 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNTFRP26992 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNTFRP26992 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNTFRP26992 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNTFRP26992 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNTFRP26992 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNTFRP26992 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNTFRP26992 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNTFRP26992 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNTFRP26992 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNTFRP26992 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNTFRP26992 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNTFRP26992 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNTFRP26992 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNTFRP26992 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNTFRP26992 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNTFRP26992 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNTFRP26992 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNTFRP26992 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNTFRP26992 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNTFRP26992 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNTFRP26992 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNTFRP26992 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNTFRP26992 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNTFRP26992 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CNTFRP26992 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CNTFRP26992 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNTFRP26992 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CNTFRP26992 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNTFRP26992 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CNTFRP26992 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNTFRP26992 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNTFRP26992 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNTFRP26992 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNTFRP26992 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNTFRP26992 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNTFRP26992 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms