Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD27P26842 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CD27P26842 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD27P26842 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD27P26842 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD27P26842 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD27P26842 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD27P26842 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD27P26842 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD27P26842 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD27P26842 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD27P26842 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD27P26842 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD27P26842 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CD27P26842 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD27P26842 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD27P26842 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD27P26842 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD27P26842 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD27P26842 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CD27P26842 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD27P26842 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CD27P26842 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CD27P26842 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD27P26842 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CD27P26842 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD27P26842 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CD27P26842 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD27P26842 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD27P26842 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD27P26842 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD27P26842 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD27P26842 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CD27P26842 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD27P26842 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD27P26842 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD27P26842 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CD27P26842 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD27P26842 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD27P26842 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD27P26842 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD27P26842 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD27P26842 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD27P26842 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD27P26842 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD27P26842 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD27P26842 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD27P26842 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD27P26842 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD27P26842 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD27P26842 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD27P26842 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD27P26842 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD27P26842 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD27P26842 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD27P26842 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD27P26842 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD27P26842 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD27P26842 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD27P26842 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD27P26842 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD27P26842 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD27P26842 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD27P26842 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD27P26842 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD27P26842 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD27P26842 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD27P26842 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD27P26842 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD27P26842 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD27P26842 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD27P26842 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD27P26842 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD27P26842 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD27P26842 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD27P26842 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD27P26842 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD27P26842 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD27P26842 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD27P26842 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD27P26842 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD27P26842 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD27P26842 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD27P26842 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD27P26842 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD27P26842 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CD27P26842 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD27P26842 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD27P26842 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD27P26842 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD27P26842 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD27P26842 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD27P26842 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD27P26842 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD27P26842 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD27P26842 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD27P26842 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD27P26842 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD27P26842 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD27P26842 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms