Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHMLP26374 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHMLP26374 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHMLP26374 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHMLP26374 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHMLP26374 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHMLP26374 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHMLP26374 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHMLP26374 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHMLP26374 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHMLP26374 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CHMLP26374 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHMLP26374 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHMLP26374 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHMLP26374 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHMLP26374 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHMLP26374 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CHMLP26374 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHMLP26374 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHMLP26374 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHMLP26374 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CHMLP26374 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHMLP26374 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHMLP26374 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CHMLP26374 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHMLP26374 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHMLP26374 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CHMLP26374 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHMLP26374 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHMLP26374 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHMLP26374 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHMLP26374 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHMLP26374 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHMLP26374 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHMLP26374 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CHMLP26374 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHMLP26374 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHMLP26374 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHMLP26374 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHMLP26374 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHMLP26374 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHMLP26374 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHMLP26374 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHMLP26374 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHMLP26374 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHMLP26374 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHMLP26374 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHMLP26374 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHMLP26374 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHMLP26374 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CHMLP26374 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CHMLP26374 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHMLP26374 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHMLP26374 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHMLP26374 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHMLP26374 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CHMLP26374 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHMLP26374 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHMLP26374 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHMLP26374 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHMLP26374 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHMLP26374 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHMLP26374 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHMLP26374 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHMLP26374 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHMLP26374 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHMLP26374 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHMLP26374 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHMLP26374 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHMLP26374 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHMLP26374 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHMLP26374 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHMLP26374 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHMLP26374 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CHMLP26374 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHMLP26374 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHMLP26374 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHMLP26374 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHMLP26374 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHMLP26374 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHMLP26374 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHMLP26374 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHMLP26374 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CHMLP26374 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHMLP26374 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CHMLP26374 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CHMLP26374 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CHMLP26374 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHMLP26374 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHMLP26374 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHMLP26374 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHMLP26374 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHMLP26374 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHMLP26374 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHMLP26374 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHMLP26374 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHMLP26374 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHMLP26374 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHMLP26374 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHMLP26374 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms