Protein–RNA interactions for Protein: P26010

ITGB7, Integrin beta-7, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB7P26010 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB7P26010 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB7P26010 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB7P26010 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB7P26010 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB7P26010 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB7P26010 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB7P26010 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB7P26010 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB7P26010 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB7P26010 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB7P26010 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB7P26010 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB7P26010 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB7P26010 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB7P26010 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB7P26010 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB7P26010 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB7P26010 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB7P26010 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB7P26010 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB7P26010 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB7P26010 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB7P26010 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB7P26010 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB7P26010 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB7P26010 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGB7P26010 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGB7P26010 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGB7P26010 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGB7P26010 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGB7P26010 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGB7P26010 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB7P26010 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB7P26010 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB7P26010 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB7P26010 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB7P26010 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB7P26010 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB7P26010 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB7P26010 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB7P26010 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB7P26010 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB7P26010 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB7P26010 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB7P26010 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB7P26010 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB7P26010 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB7P26010 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB7P26010 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB7P26010 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB7P26010 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB7P26010 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB7P26010 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB7P26010 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB7P26010 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB7P26010 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB7P26010 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB7P26010 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB7P26010 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB7P26010 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB7P26010 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB7P26010 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB7P26010 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB7P26010 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB7P26010 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB7P26010 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB7P26010 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB7P26010 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB7P26010 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB7P26010 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB7P26010 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB7P26010 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB7P26010 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB7P26010 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB7P26010 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB7P26010 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB7P26010 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB7P26010 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB7P26010 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB7P26010 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB7P26010 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB7P26010 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB7P26010 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB7P26010 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB7P26010 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGB7P26010 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGB7P26010 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGB7P26010 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGB7P26010 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGB7P26010 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGB7P26010 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGB7P26010 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGB7P26010 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB7P26010 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB7P26010 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB7P26010 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB7P26010 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB7P26010 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB7P26010 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms