Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCM3P25205 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCM3P25205 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCM3P25205 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCM3P25205 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCM3P25205 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCM3P25205 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCM3P25205 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MCM3P25205 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCM3P25205 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCM3P25205 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCM3P25205 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCM3P25205 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCM3P25205 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCM3P25205 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCM3P25205 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCM3P25205 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCM3P25205 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCM3P25205 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCM3P25205 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCM3P25205 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCM3P25205 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCM3P25205 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCM3P25205 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCM3P25205 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCM3P25205 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCM3P25205 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCM3P25205 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCM3P25205 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCM3P25205 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCM3P25205 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCM3P25205 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCM3P25205 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCM3P25205 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCM3P25205 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCM3P25205 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCM3P25205 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCM3P25205 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCM3P25205 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCM3P25205 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCM3P25205 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCM3P25205 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCM3P25205 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCM3P25205 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCM3P25205 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCM3P25205 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MCM3P25205 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MCM3P25205 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MCM3P25205 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MCM3P25205 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MCM3P25205 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCM3P25205 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCM3P25205 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCM3P25205 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCM3P25205 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MCM3P25205 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MCM3P25205 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MCM3P25205 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCM3P25205 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCM3P25205 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCM3P25205 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCM3P25205 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCM3P25205 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCM3P25205 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCM3P25205 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCM3P25205 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCM3P25205 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCM3P25205 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM3P25205 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM3P25205 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM3P25205 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM3P25205 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM3P25205 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM3P25205 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM3P25205 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM3P25205 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM3P25205 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM3P25205 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM3P25205 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCM3P25205 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCM3P25205 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCM3P25205 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCM3P25205 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCM3P25205 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCM3P25205 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCM3P25205 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCM3P25205 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCM3P25205 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCM3P25205 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCM3P25205 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCM3P25205 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCM3P25205 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCM3P25205 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MCM3P25205 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCM3P25205 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCM3P25205 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCM3P25205 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCM3P25205 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCM3P25205 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCM3P25205 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms