Protein–RNA interactions for Protein: P23942

PRPH2, Peripherin-2, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPH2P23942 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPH2P23942 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPH2P23942 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPH2P23942 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPH2P23942 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPH2P23942 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPH2P23942 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPH2P23942 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPH2P23942 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPH2P23942 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPH2P23942 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPH2P23942 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPH2P23942 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPH2P23942 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPH2P23942 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPH2P23942 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPH2P23942 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPH2P23942 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPH2P23942 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPH2P23942 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPH2P23942 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPH2P23942 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPH2P23942 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPH2P23942 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPH2P23942 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPH2P23942 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPH2P23942 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPH2P23942 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPH2P23942 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPH2P23942 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPH2P23942 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPH2P23942 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPH2P23942 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPH2P23942 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPH2P23942 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPH2P23942 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPH2P23942 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPH2P23942 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPH2P23942 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPH2P23942 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPH2P23942 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPH2P23942 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPH2P23942 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPH2P23942 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPH2P23942 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPH2P23942 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPH2P23942 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPH2P23942 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPH2P23942 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPH2P23942 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPH2P23942 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPH2P23942 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPH2P23942 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPH2P23942 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPH2P23942 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPH2P23942 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPH2P23942 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPH2P23942 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPH2P23942 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPH2P23942 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPH2P23942 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPH2P23942 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPH2P23942 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPH2P23942 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPH2P23942 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPH2P23942 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPH2P23942 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPH2P23942 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPH2P23942 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPH2P23942 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPH2P23942 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPH2P23942 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPH2P23942 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPH2P23942 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPH2P23942 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPH2P23942 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPH2P23942 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPH2P23942 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPH2P23942 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPH2P23942 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPH2P23942 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRPH2P23942 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPH2P23942 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPH2P23942 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPH2P23942 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPH2P23942 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPH2P23942 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPH2P23942 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPH2P23942 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPH2P23942 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPH2P23942 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPH2P23942 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPH2P23942 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPH2P23942 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPH2P23942 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPH2P23942 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPH2P23942 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPH2P23942 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPH2P23942 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPH2P23942 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms