Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPREP23469 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPREP23469 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPREP23469 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPREP23469 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPREP23469 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPREP23469 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPREP23469 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPREP23469 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPREP23469 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPREP23469 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPREP23469 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPREP23469 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPREP23469 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPREP23469 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPREP23469 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPREP23469 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPREP23469 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPREP23469 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPREP23469 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPREP23469 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPREP23469 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPREP23469 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPREP23469 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPREP23469 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPREP23469 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPREP23469 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPREP23469 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPREP23469 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPREP23469 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPREP23469 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTPREP23469 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTPREP23469 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPREP23469 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPREP23469 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPREP23469 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPREP23469 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPREP23469 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPREP23469 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPREP23469 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPREP23469 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPREP23469 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPREP23469 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPREP23469 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPREP23469 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPREP23469 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPREP23469 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPREP23469 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPREP23469 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPREP23469 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPREP23469 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPREP23469 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPREP23469 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPREP23469 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPREP23469 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPREP23469 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPREP23469 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPREP23469 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPREP23469 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPREP23469 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPREP23469 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPREP23469 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPREP23469 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPREP23469 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPREP23469 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPREP23469 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPREP23469 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PTPREP23469 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPREP23469 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPREP23469 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPREP23469 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPREP23469 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPREP23469 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPREP23469 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPREP23469 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPREP23469 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPREP23469 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPREP23469 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPREP23469 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPREP23469 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PTPREP23469 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPREP23469 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPREP23469 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPREP23469 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPREP23469 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPREP23469 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPREP23469 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPREP23469 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPREP23469 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPREP23469 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPREP23469 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPREP23469 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPREP23469 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPREP23469 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPREP23469 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PTPREP23469 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPREP23469 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPREP23469 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPREP23469 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPREP23469 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms