Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ME2P23368 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ME2P23368 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ME2P23368 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ME2P23368 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ME2P23368 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ME2P23368 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ME2P23368 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ME2P23368 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ME2P23368 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ME2P23368 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ME2P23368 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ME2P23368 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ME2P23368 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ME2P23368 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ME2P23368 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ME2P23368 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ME2P23368 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME2P23368 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME2P23368 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME2P23368 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME2P23368 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME2P23368 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ME2P23368 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ME2P23368 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ME2P23368 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ME2P23368 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ME2P23368 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ME2P23368 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ME2P23368 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ME2P23368 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ME2P23368 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ME2P23368 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ME2P23368 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ME2P23368 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ME2P23368 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ME2P23368 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ME2P23368 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ME2P23368 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ME2P23368 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ME2P23368 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ME2P23368 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ME2P23368 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ME2P23368 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ME2P23368 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ME2P23368 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ME2P23368 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ME2P23368 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ME2P23368 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ME2P23368 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ME2P23368 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ME2P23368 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ME2P23368 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ME2P23368 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ME2P23368 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ME2P23368 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ME2P23368 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ME2P23368 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ME2P23368 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ME2P23368 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ME2P23368 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ME2P23368 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ME2P23368 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ME2P23368 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ME2P23368 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ME2P23368 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ME2P23368 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ME2P23368 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ME2P23368 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ME2P23368 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ME2P23368 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ME2P23368 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ME2P23368 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ME2P23368 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ME2P23368 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ME2P23368 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ME2P23368 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ME2P23368 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ME2P23368 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ME2P23368 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ME2P23368 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ME2P23368 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ME2P23368 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ME2P23368 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ME2P23368 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ME2P23368 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ME2P23368 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ME2P23368 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ME2P23368 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ME2P23368 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ME2P23368 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ME2P23368 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ME2P23368 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ME2P23368 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ME2P23368 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ME2P23368 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ME2P23368 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ME2P23368 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ME2P23368 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ME2P23368 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms