Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN3P20807 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN3P20807 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN3P20807 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN3P20807 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN3P20807 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN3P20807 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN3P20807 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN3P20807 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN3P20807 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN3P20807 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN3P20807 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN3P20807 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN3P20807 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN3P20807 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN3P20807 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN3P20807 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN3P20807 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN3P20807 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN3P20807 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN3P20807 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN3P20807 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN3P20807 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN3P20807 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN3P20807 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN3P20807 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN3P20807 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN3P20807 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN3P20807 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN3P20807 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN3P20807 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN3P20807 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN3P20807 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN3P20807 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN3P20807 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN3P20807 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN3P20807 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN3P20807 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN3P20807 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN3P20807 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN3P20807 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN3P20807 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN3P20807 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN3P20807 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN3P20807 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN3P20807 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN3P20807 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN3P20807 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN3P20807 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN3P20807 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN3P20807 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN3P20807 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN3P20807 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN3P20807 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN3P20807 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN3P20807 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN3P20807 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN3P20807 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN3P20807 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN3P20807 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN3P20807 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN3P20807 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN3P20807 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN3P20807 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN3P20807 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN3P20807 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN3P20807 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN3P20807 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN3P20807 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN3P20807 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN3P20807 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN3P20807 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN3P20807 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN3P20807 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN3P20807 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN3P20807 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN3P20807 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN3P20807 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN3P20807 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN3P20807 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN3P20807 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN3P20807 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN3P20807 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN3P20807 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAPN3P20807 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAPN3P20807 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAPN3P20807 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAPN3P20807 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAPN3P20807 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN3P20807 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN3P20807 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN3P20807 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN3P20807 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN3P20807 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN3P20807 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN3P20807 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN3P20807 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN3P20807 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN3P20807 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN3P20807 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms