Protein–RNA interactions for Protein: P20333

TNFRSF1B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF1BP20333 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TNFRSF1BP20333 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TNFRSF1BP20333 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TNFRSF1BP20333 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TNFRSF1BP20333 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TNFRSF1BP20333 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFRSF1BP20333 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFRSF1BP20333 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFRSF1BP20333 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFRSF1BP20333 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFRSF1BP20333 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFRSF1BP20333 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFRSF1BP20333 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFRSF1BP20333 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFRSF1BP20333 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFRSF1BP20333 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFRSF1BP20333 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFRSF1BP20333 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFRSF1BP20333 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFRSF1BP20333 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFRSF1BP20333 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFRSF1BP20333 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFRSF1BP20333 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFRSF1BP20333 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFRSF1BP20333 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFRSF1BP20333 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFRSF1BP20333 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFRSF1BP20333 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFRSF1BP20333 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFRSF1BP20333 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFRSF1BP20333 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFRSF1BP20333 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFRSF1BP20333 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFRSF1BP20333 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFRSF1BP20333 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFRSF1BP20333 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFRSF1BP20333 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFRSF1BP20333 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFRSF1BP20333 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFRSF1BP20333 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFRSF1BP20333 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFRSF1BP20333 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFRSF1BP20333 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms