Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNA2P20248 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNA2P20248 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNA2P20248 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNA2P20248 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNA2P20248 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNA2P20248 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNA2P20248 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNA2P20248 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNA2P20248 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNA2P20248 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNA2P20248 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNA2P20248 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNA2P20248 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNA2P20248 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNA2P20248 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNA2P20248 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNA2P20248 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNA2P20248 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNA2P20248 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNA2P20248 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNA2P20248 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNA2P20248 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNA2P20248 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNA2P20248 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNA2P20248 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNA2P20248 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNA2P20248 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNA2P20248 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNA2P20248 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNA2P20248 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNA2P20248 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNA2P20248 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNA2P20248 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNA2P20248 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNA2P20248 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCNA2P20248 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCNA2P20248 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNA2P20248 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNA2P20248 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNA2P20248 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNA2P20248 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNA2P20248 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNA2P20248 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNA2P20248 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNA2P20248 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNA2P20248 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCNA2P20248 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNA2P20248 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCNA2P20248 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCNA2P20248 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNA2P20248 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCNA2P20248 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNA2P20248 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNA2P20248 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNA2P20248 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNA2P20248 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNA2P20248 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNA2P20248 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNA2P20248 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNA2P20248 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNA2P20248 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNA2P20248 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNA2P20248 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNA2P20248 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNA2P20248 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNA2P20248 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNA2P20248 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNA2P20248 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNA2P20248 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNA2P20248 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNA2P20248 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNA2P20248 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNA2P20248 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNA2P20248 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNA2P20248 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNA2P20248 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNA2P20248 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNA2P20248 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNA2P20248 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNA2P20248 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNA2P20248 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNA2P20248 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNA2P20248 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNA2P20248 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNA2P20248 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNA2P20248 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNA2P20248 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNA2P20248 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNA2P20248 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNA2P20248 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNA2P20248 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNA2P20248 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNA2P20248 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNA2P20248 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNA2P20248 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNA2P20248 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCNA2P20248 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCNA2P20248 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCNA2P20248 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms