Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms