Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCLP19338 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCLP19338 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCLP19338 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCLP19338 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCLP19338 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCLP19338 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCLP19338 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NCLP19338 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCLP19338 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCLP19338 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCLP19338 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCLP19338 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NCLP19338 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCLP19338 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCLP19338 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCLP19338 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCLP19338 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCLP19338 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCLP19338 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCLP19338 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NCLP19338 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NCLP19338 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NCLP19338 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NCLP19338 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NCLP19338 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NCLP19338 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NCLP19338 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NCLP19338 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NCLP19338 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NCLP19338 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NCLP19338 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCLP19338 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCLP19338 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCLP19338 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCLP19338 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCLP19338 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCLP19338 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCLP19338 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCLP19338 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCLP19338 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCLP19338 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCLP19338 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCLP19338 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCLP19338 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCLP19338 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCLP19338 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCLP19338 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCLP19338 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCLP19338 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCLP19338 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCLP19338 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCLP19338 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCLP19338 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCLP19338 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCLP19338 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCLP19338 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCLP19338 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCLP19338 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCLP19338 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCLP19338 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCLP19338 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NCLP19338 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCLP19338 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCLP19338 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCLP19338 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCLP19338 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCLP19338 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCLP19338 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCLP19338 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCLP19338 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NCLP19338 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
NCLP19338 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NCLP19338 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCLP19338 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCLP19338 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NCLP19338 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCLP19338 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCLP19338 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCLP19338 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCLP19338 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCLP19338 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCLP19338 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCLP19338 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCLP19338 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCLP19338 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCLP19338 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCLP19338 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCLP19338 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCLP19338 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCLP19338 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCLP19338 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCLP19338 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCLP19338 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCLP19338 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCLP19338 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCLP19338 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCLP19338 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCLP19338 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCLP19338 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms