Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT4P19013 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT4P19013 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT4P19013 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT4P19013 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT4P19013 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT4P19013 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT4P19013 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT4P19013 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT4P19013 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT4P19013 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT4P19013 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT4P19013 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT4P19013 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT4P19013 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT4P19013 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT4P19013 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT4P19013 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT4P19013 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT4P19013 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT4P19013 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT4P19013 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT4P19013 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT4P19013 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT4P19013 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT4P19013 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT4P19013 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT4P19013 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT4P19013 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT4P19013 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT4P19013 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT4P19013 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT4P19013 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT4P19013 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT4P19013 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT4P19013 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT4P19013 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT4P19013 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT4P19013 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT4P19013 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT4P19013 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT4P19013 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT4P19013 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT4P19013 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT4P19013 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT4P19013 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT4P19013 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT4P19013 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT4P19013 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT4P19013 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT4P19013 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT4P19013 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT4P19013 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT4P19013 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT4P19013 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT4P19013 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT4P19013 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT4P19013 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT4P19013 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT4P19013 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT4P19013 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT4P19013 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT4P19013 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT4P19013 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT4P19013 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT4P19013 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT4P19013 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT4P19013 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT4P19013 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT4P19013 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT4P19013 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT4P19013 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT4P19013 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT4P19013 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT4P19013 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT4P19013 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT4P19013 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT4P19013 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT4P19013 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT4P19013 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT4P19013 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT4P19013 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT4P19013 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT4P19013 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT4P19013 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT4P19013 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT4P19013 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT4P19013 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT4P19013 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT4P19013 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT4P19013 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT4P19013 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT4P19013 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT4P19013 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT4P19013 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT4P19013 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT4P19013 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT4P19013 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT4P19013 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT4P19013 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms