Protein–RNA interactions for Protein: P19012

KRT15, Keratin, type I cytoskeletal 15, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT15P19012 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT15P19012 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT15P19012 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT15P19012 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT15P19012 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT15P19012 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT15P19012 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT15P19012 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT15P19012 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT15P19012 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT15P19012 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT15P19012 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT15P19012 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT15P19012 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT15P19012 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT15P19012 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT15P19012 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT15P19012 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT15P19012 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT15P19012 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT15P19012 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT15P19012 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT15P19012 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT15P19012 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT15P19012 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT15P19012 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT15P19012 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT15P19012 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT15P19012 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT15P19012 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT15P19012 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT15P19012 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT15P19012 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT15P19012 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT15P19012 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT15P19012 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT15P19012 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT15P19012 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT15P19012 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT15P19012 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT15P19012 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT15P19012 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT15P19012 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT15P19012 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT15P19012 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT15P19012 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT15P19012 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT15P19012 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT15P19012 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT15P19012 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT15P19012 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT15P19012 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT15P19012 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT15P19012 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT15P19012 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT15P19012 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT15P19012 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT15P19012 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT15P19012 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT15P19012 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT15P19012 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT15P19012 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT15P19012 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT15P19012 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT15P19012 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT15P19012 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT15P19012 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT15P19012 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT15P19012 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT15P19012 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT15P19012 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT15P19012 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT15P19012 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT15P19012 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT15P19012 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT15P19012 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT15P19012 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT15P19012 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT15P19012 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT15P19012 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT15P19012 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT15P19012 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT15P19012 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT15P19012 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT15P19012 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KRT15P19012 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KRT15P19012 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT15P19012 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT15P19012 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT15P19012 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT15P19012 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT15P19012 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT15P19012 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT15P19012 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT15P19012 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT15P19012 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT15P19012 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT15P19012 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT15P19012 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT15P19012 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms