Protein–RNA interactions for Protein: P17948

FLT1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT1P17948 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
FLT1P17948 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
FLT1P17948 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FLT1P17948 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FLT1P17948 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FLT1P17948 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FLT1P17948 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FLT1P17948 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FLT1P17948 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FLT1P17948 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FLT1P17948 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FLT1P17948 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FLT1P17948 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FLT1P17948 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FLT1P17948 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FLT1P17948 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FLT1P17948 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FLT1P17948 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FLT1P17948 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FLT1P17948 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FLT1P17948 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
FLT1P17948 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FLT1P17948 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FLT1P17948 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FLT1P17948 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FLT1P17948 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FLT1P17948 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FLT1P17948 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FLT1P17948 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FLT1P17948 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FLT1P17948 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FLT1P17948 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FLT1P17948 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FLT1P17948 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FLT1P17948 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FLT1P17948 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FLT1P17948 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FLT1P17948 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FLT1P17948 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FLT1P17948 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
FLT1P17948 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FLT1P17948 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FLT1P17948 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FLT1P17948 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FLT1P17948 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FLT1P17948 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
FLT1P17948 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FLT1P17948 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FLT1P17948 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FLT1P17948 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
FLT1P17948 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
FLT1P17948 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FLT1P17948 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FLT1P17948 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
FLT1P17948 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FLT1P17948 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FLT1P17948 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FLT1P17948 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FLT1P17948 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FLT1P17948 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FLT1P17948 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FLT1P17948 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FLT1P17948 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FLT1P17948 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FLT1P17948 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
FLT1P17948 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
FLT1P17948 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FLT1P17948 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FLT1P17948 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FLT1P17948 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FLT1P17948 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FLT1P17948 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FLT1P17948 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FLT1P17948 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FLT1P17948 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FLT1P17948 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
FLT1P17948 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
FLT1P17948 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FLT1P17948 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FLT1P17948 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FLT1P17948 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FLT1P17948 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FLT1P17948 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FLT1P17948 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FLT1P17948 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FLT1P17948 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FLT1P17948 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FLT1P17948 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FLT1P17948 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FLT1P17948 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FLT1P17948 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FLT1P17948 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FLT1P17948 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FLT1P17948 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FLT1P17948 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FLT1P17948 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FLT1P17948 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FLT1P17948 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FLT1P17948 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FLT1P17948 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms