Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXB8P17481 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXB8P17481 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXB8P17481 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXB8P17481 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXB8P17481 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXB8P17481 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXB8P17481 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXB8P17481 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXB8P17481 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXB8P17481 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXB8P17481 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXB8P17481 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXB8P17481 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXB8P17481 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXB8P17481 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXB8P17481 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXB8P17481 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXB8P17481 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXB8P17481 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXB8P17481 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXB8P17481 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXB8P17481 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXB8P17481 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXB8P17481 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXB8P17481 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXB8P17481 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXB8P17481 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXB8P17481 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXB8P17481 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXB8P17481 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXB8P17481 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXB8P17481 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXB8P17481 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXB8P17481 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXB8P17481 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXB8P17481 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXB8P17481 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXB8P17481 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXB8P17481 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXB8P17481 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXB8P17481 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXB8P17481 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXB8P17481 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXB8P17481 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXB8P17481 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXB8P17481 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXB8P17481 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXB8P17481 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXB8P17481 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXB8P17481 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXB8P17481 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXB8P17481 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXB8P17481 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXB8P17481 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXB8P17481 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXB8P17481 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXB8P17481 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXB8P17481 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXB8P17481 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXB8P17481 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXB8P17481 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXB8P17481 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXB8P17481 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXB8P17481 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXB8P17481 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXB8P17481 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXB8P17481 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXB8P17481 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXB8P17481 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXB8P17481 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXB8P17481 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXB8P17481 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXB8P17481 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXB8P17481 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXB8P17481 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXB8P17481 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXB8P17481 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXB8P17481 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXB8P17481 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXB8P17481 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXB8P17481 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXB8P17481 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXB8P17481 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXB8P17481 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXB8P17481 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXB8P17481 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXB8P17481 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXB8P17481 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXB8P17481 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXB8P17481 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXB8P17481 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXB8P17481 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXB8P17481 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXB8P17481 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXB8P17481 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXB8P17481 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXB8P17481 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXB8P17481 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXB8P17481 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms