Protein–RNA interactions for Protein: P17081

RHOQ, Rho-related GTP-binding protein RhoQ, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOQP17081 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOQP17081 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOQP17081 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOQP17081 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOQP17081 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOQP17081 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOQP17081 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOQP17081 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOQP17081 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOQP17081 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOQP17081 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOQP17081 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOQP17081 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOQP17081 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOQP17081 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOQP17081 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOQP17081 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOQP17081 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOQP17081 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOQP17081 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOQP17081 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOQP17081 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOQP17081 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOQP17081 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOQP17081 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOQP17081 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOQP17081 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOQP17081 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOQP17081 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOQP17081 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOQP17081 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOQP17081 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOQP17081 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOQP17081 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOQP17081 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOQP17081 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOQP17081 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOQP17081 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOQP17081 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOQP17081 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOQP17081 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOQP17081 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOQP17081 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOQP17081 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOQP17081 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOQP17081 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOQP17081 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOQP17081 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOQP17081 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOQP17081 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHOQP17081 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RHOQP17081 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHOQP17081 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHOQP17081 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHOQP17081 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHOQP17081 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHOQP17081 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHOQP17081 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHOQP17081 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RHOQP17081 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHOQP17081 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHOQP17081 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHOQP17081 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RHOQP17081 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOQP17081 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOQP17081 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOQP17081 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOQP17081 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOQP17081 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOQP17081 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOQP17081 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOQP17081 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOQP17081 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOQP17081 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOQP17081 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOQP17081 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOQP17081 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOQP17081 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOQP17081 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOQP17081 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOQP17081 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOQP17081 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOQP17081 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOQP17081 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOQP17081 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOQP17081 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOQP17081 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOQP17081 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOQP17081 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOQP17081 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOQP17081 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOQP17081 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOQP17081 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOQP17081 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOQP17081 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOQP17081 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOQP17081 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOQP17081 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOQP17081 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOQP17081 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms