Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPB42P16452 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPB42P16452 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPB42P16452 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPB42P16452 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPB42P16452 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPB42P16452 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPB42P16452 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPB42P16452 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPB42P16452 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPB42P16452 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPB42P16452 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPB42P16452 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPB42P16452 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPB42P16452 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPB42P16452 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPB42P16452 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPB42P16452 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPB42P16452 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPB42P16452 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPB42P16452 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPB42P16452 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPB42P16452 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPB42P16452 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPB42P16452 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPB42P16452 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPB42P16452 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPB42P16452 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPB42P16452 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EPB42P16452 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EPB42P16452 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPB42P16452 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EPB42P16452 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EPB42P16452 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EPB42P16452 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EPB42P16452 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPB42P16452 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPB42P16452 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPB42P16452 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPB42P16452 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPB42P16452 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPB42P16452 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPB42P16452 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPB42P16452 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPB42P16452 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPB42P16452 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPB42P16452 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPB42P16452 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPB42P16452 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPB42P16452 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPB42P16452 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EPB42P16452 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPB42P16452 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPB42P16452 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPB42P16452 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPB42P16452 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPB42P16452 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPB42P16452 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPB42P16452 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPB42P16452 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPB42P16452 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPB42P16452 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPB42P16452 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPB42P16452 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPB42P16452 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPB42P16452 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPB42P16452 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPB42P16452 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPB42P16452 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPB42P16452 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EPB42P16452 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPB42P16452 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPB42P16452 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPB42P16452 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EPB42P16452 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPB42P16452 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EPB42P16452 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPB42P16452 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPB42P16452 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPB42P16452 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPB42P16452 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPB42P16452 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPB42P16452 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPB42P16452 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPB42P16452 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPB42P16452 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPB42P16452 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPB42P16452 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPB42P16452 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPB42P16452 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPB42P16452 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EPB42P16452 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EPB42P16452 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPB42P16452 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPB42P16452 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPB42P16452 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPB42P16452 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPB42P16452 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPB42P16452 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPB42P16452 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms