Protein–RNA interactions for Protein: P14543

NID1, Nidogen-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID1P14543 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NID1P14543 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NID1P14543 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NID1P14543 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NID1P14543 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NID1P14543 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NID1P14543 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NID1P14543 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NID1P14543 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NID1P14543 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NID1P14543 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NID1P14543 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NID1P14543 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NID1P14543 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NID1P14543 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NID1P14543 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NID1P14543 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NID1P14543 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NID1P14543 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NID1P14543 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NID1P14543 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NID1P14543 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NID1P14543 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NID1P14543 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NID1P14543 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NID1P14543 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NID1P14543 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NID1P14543 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NID1P14543 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NID1P14543 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NID1P14543 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NID1P14543 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NID1P14543 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NID1P14543 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NID1P14543 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NID1P14543 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NID1P14543 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NID1P14543 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NID1P14543 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NID1P14543 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NID1P14543 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NID1P14543 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NID1P14543 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NID1P14543 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NID1P14543 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NID1P14543 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NID1P14543 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NID1P14543 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NID1P14543 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NID1P14543 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NID1P14543 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NID1P14543 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NID1P14543 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NID1P14543 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NID1P14543 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NID1P14543 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NID1P14543 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NID1P14543 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NID1P14543 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NID1P14543 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NID1P14543 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NID1P14543 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NID1P14543 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NID1P14543 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NID1P14543 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NID1P14543 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NID1P14543 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NID1P14543 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NID1P14543 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NID1P14543 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NID1P14543 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NID1P14543 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NID1P14543 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NID1P14543 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NID1P14543 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NID1P14543 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NID1P14543 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NID1P14543 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NID1P14543 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NID1P14543 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NID1P14543 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NID1P14543 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NID1P14543 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NID1P14543 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NID1P14543 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NID1P14543 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NID1P14543 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NID1P14543 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NID1P14543 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NID1P14543 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NID1P14543 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
NID1P14543 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NID1P14543 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NID1P14543 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NID1P14543 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NID1P14543 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NID1P14543 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NID1P14543 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NID1P14543 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NID1P14543 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms