Protein–RNA interactions for Protein: P14136

GFAP, Glial fibrillary acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFAPP14136 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GFAPP14136 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GFAPP14136 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GFAPP14136 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GFAPP14136 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GFAPP14136 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GFAPP14136 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GFAPP14136 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GFAPP14136 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GFAPP14136 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GFAPP14136 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GFAPP14136 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GFAPP14136 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GFAPP14136 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GFAPP14136 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GFAPP14136 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GFAPP14136 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GFAPP14136 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GFAPP14136 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GFAPP14136 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GFAPP14136 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GFAPP14136 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GFAPP14136 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GFAPP14136 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GFAPP14136 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GFAPP14136 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GFAPP14136 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GFAPP14136 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GFAPP14136 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GFAPP14136 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GFAPP14136 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GFAPP14136 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GFAPP14136 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GFAPP14136 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GFAPP14136 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GFAPP14136 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GFAPP14136 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GFAPP14136 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GFAPP14136 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GFAPP14136 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GFAPP14136 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GFAPP14136 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GFAPP14136 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GFAPP14136 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GFAPP14136 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GFAPP14136 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GFAPP14136 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GFAPP14136 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GFAPP14136 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GFAPP14136 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GFAPP14136 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GFAPP14136 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GFAPP14136 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GFAPP14136 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GFAPP14136 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GFAPP14136 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GFAPP14136 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GFAPP14136 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GFAPP14136 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GFAPP14136 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GFAPP14136 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GFAPP14136 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GFAPP14136 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GFAPP14136 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GFAPP14136 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GFAPP14136 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GFAPP14136 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GFAPP14136 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GFAPP14136 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GFAPP14136 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GFAPP14136 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GFAPP14136 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GFAPP14136 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GFAPP14136 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GFAPP14136 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GFAPP14136 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GFAPP14136 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GFAPP14136 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GFAPP14136 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GFAPP14136 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GFAPP14136 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GFAPP14136 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GFAPP14136 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GFAPP14136 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GFAPP14136 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GFAPP14136 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GFAPP14136 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GFAPP14136 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GFAPP14136 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GFAPP14136 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GFAPP14136 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GFAPP14136 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GFAPP14136 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GFAPP14136 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GFAPP14136 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GFAPP14136 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GFAPP14136 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GFAPP14136 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GFAPP14136 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GFAPP14136 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms