Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNT1P13805 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNT1P13805 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNT1P13805 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNT1P13805 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNT1P13805 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNT1P13805 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNT1P13805 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNT1P13805 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNT1P13805 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNT1P13805 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNT1P13805 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNT1P13805 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNT1P13805 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNT1P13805 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNT1P13805 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNT1P13805 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNT1P13805 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNT1P13805 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNT1P13805 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNT1P13805 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNT1P13805 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNT1P13805 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNT1P13805 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNT1P13805 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNT1P13805 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNT1P13805 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNT1P13805 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNT1P13805 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNT1P13805 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNT1P13805 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNT1P13805 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNT1P13805 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNT1P13805 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNT1P13805 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNT1P13805 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNT1P13805 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNT1P13805 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNT1P13805 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNT1P13805 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNT1P13805 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNT1P13805 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNT1P13805 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNT1P13805 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNT1P13805 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNT1P13805 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNT1P13805 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNT1P13805 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNT1P13805 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNT1P13805 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNT1P13805 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNT1P13805 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNT1P13805 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TNNT1P13805 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNNT1P13805 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNNT1P13805 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNNT1P13805 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TNNT1P13805 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNNT1P13805 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNNT1P13805 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNNT1P13805 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNNT1P13805 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNT1P13805 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNT1P13805 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNT1P13805 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNT1P13805 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNT1P13805 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNT1P13805 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNT1P13805 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNT1P13805 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNT1P13805 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNT1P13805 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNT1P13805 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNT1P13805 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNT1P13805 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNT1P13805 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNT1P13805 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNT1P13805 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNT1P13805 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNT1P13805 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNT1P13805 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNT1P13805 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNNT1P13805 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNNT1P13805 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TNNT1P13805 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNNT1P13805 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNNT1P13805 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNNT1P13805 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNNT1P13805 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNNT1P13805 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNNT1P13805 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNNT1P13805 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNNT1P13805 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNNT1P13805 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNNT1P13805 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNNT1P13805 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNNT1P13805 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNNT1P13805 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNNT1P13805 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNNT1P13805 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms