Protein–RNA interactions for Protein: P11802

CDK4, Cyclin-dependent kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK4P11802 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK4P11802 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK4P11802 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK4P11802 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK4P11802 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK4P11802 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK4P11802 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK4P11802 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK4P11802 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK4P11802 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK4P11802 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK4P11802 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK4P11802 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK4P11802 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK4P11802 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK4P11802 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK4P11802 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK4P11802 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK4P11802 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK4P11802 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK4P11802 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK4P11802 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK4P11802 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK4P11802 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK4P11802 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK4P11802 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK4P11802 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK4P11802 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK4P11802 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK4P11802 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK4P11802 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK4P11802 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK4P11802 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK4P11802 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK4P11802 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK4P11802 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK4P11802 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK4P11802 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK4P11802 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK4P11802 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK4P11802 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK4P11802 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK4P11802 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK4P11802 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK4P11802 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK4P11802 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK4P11802 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK4P11802 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK4P11802 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK4P11802 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK4P11802 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK4P11802 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK4P11802 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK4P11802 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK4P11802 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK4P11802 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK4P11802 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK4P11802 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK4P11802 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK4P11802 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK4P11802 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK4P11802 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK4P11802 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK4P11802 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK4P11802 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK4P11802 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK4P11802 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK4P11802 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK4P11802 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK4P11802 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK4P11802 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK4P11802 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK4P11802 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK4P11802 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK4P11802 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK4P11802 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK4P11802 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK4P11802 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK4P11802 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK4P11802 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK4P11802 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK4P11802 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK4P11802 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK4P11802 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK4P11802 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK4P11802 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK4P11802 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK4P11802 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK4P11802 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK4P11802 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK4P11802 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK4P11802 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK4P11802 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK4P11802 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK4P11802 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK4P11802 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK4P11802 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK4P11802 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK4P11802 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK4P11802 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms