Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NR2F1P10589 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR2F1P10589 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR2F1P10589 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR2F1P10589 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NR2F1P10589 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR2F1P10589 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NR2F1P10589 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR2F1P10589 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NR2F1P10589 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR2F1P10589 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR2F1P10589 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR2F1P10589 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NR2F1P10589 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR2F1P10589 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR2F1P10589 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR2F1P10589 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR2F1P10589 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR2F1P10589 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR2F1P10589 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR2F1P10589 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NR2F1P10589 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NR2F1P10589 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NR2F1P10589 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NR2F1P10589 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NR2F1P10589 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR2F1P10589 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR2F1P10589 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR2F1P10589 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR2F1P10589 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR2F1P10589 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR2F1P10589 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR2F1P10589 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR2F1P10589 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR2F1P10589 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NR2F1P10589 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR2F1P10589 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NR2F1P10589 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR2F1P10589 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR2F1P10589 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR2F1P10589 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR2F1P10589 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR2F1P10589 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR2F1P10589 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR2F1P10589 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR2F1P10589 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR2F1P10589 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR2F1P10589 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR2F1P10589 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR2F1P10589 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR2F1P10589 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR2F1P10589 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR2F1P10589 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR2F1P10589 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR2F1P10589 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR2F1P10589 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR2F1P10589 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR2F1P10589 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR2F1P10589 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR2F1P10589 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR2F1P10589 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR2F1P10589 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR2F1P10589 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR2F1P10589 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR2F1P10589 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR2F1P10589 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NR2F1P10589 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR2F1P10589 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR2F1P10589 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR2F1P10589 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR2F1P10589 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR2F1P10589 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR2F1P10589 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR2F1P10589 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR2F1P10589 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NR2F1P10589 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR2F1P10589 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR2F1P10589 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NR2F1P10589 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR2F1P10589 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR2F1P10589 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR2F1P10589 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR2F1P10589 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR2F1P10589 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR2F1P10589 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR2F1P10589 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR2F1P10589 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR2F1P10589 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR2F1P10589 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR2F1P10589 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NR2F1P10589 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NR2F1P10589 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NR2F1P10589 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NR2F1P10589 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NR2F1P10589 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR2F1P10589 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR2F1P10589 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR2F1P10589 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NR2F1P10589 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR2F1P10589 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms