Protein–RNA interactions for Protein: P10276

RARA, Retinoic acid receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARAP10276 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RARAP10276 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RARAP10276 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RARAP10276 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RARAP10276 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RARAP10276 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RARAP10276 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RARAP10276 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RARAP10276 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RARAP10276 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RARAP10276 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RARAP10276 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RARAP10276 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RARAP10276 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RARAP10276 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RARAP10276 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RARAP10276 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RARAP10276 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RARAP10276 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RARAP10276 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RARAP10276 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RARAP10276 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RARAP10276 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RARAP10276 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RARAP10276 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RARAP10276 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RARAP10276 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RARAP10276 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RARAP10276 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RARAP10276 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RARAP10276 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RARAP10276 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RARAP10276 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RARAP10276 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RARAP10276 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RARAP10276 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RARAP10276 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RARAP10276 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RARAP10276 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RARAP10276 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RARAP10276 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RARAP10276 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RARAP10276 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RARAP10276 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RARAP10276 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RARAP10276 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RARAP10276 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RARAP10276 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RARAP10276 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RARAP10276 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RARAP10276 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RARAP10276 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RARAP10276 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RARAP10276 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RARAP10276 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RARAP10276 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RARAP10276 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RARAP10276 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RARAP10276 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RARAP10276 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RARAP10276 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RARAP10276 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RARAP10276 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RARAP10276 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RARAP10276 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RARAP10276 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RARAP10276 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RARAP10276 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RARAP10276 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RARAP10276 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RARAP10276 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RARAP10276 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RARAP10276 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RARAP10276 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RARAP10276 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RARAP10276 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RARAP10276 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RARAP10276 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RARAP10276 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RARAP10276 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RARAP10276 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RARAP10276 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RARAP10276 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RARAP10276 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RARAP10276 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RARAP10276 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RARAP10276 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RARAP10276 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RARAP10276 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RARAP10276 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RARAP10276 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RARAP10276 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RARAP10276 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RARAP10276 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RARAP10276 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RARAP10276 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RARAP10276 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RARAP10276 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RARAP10276 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RARAP10276 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms